هیأت حل اختلاف مالیاتی اولین مرحله اعتراض رسمی بشمار میرود. در مرحله قبل مودی سعی میکند تا ذیل ماده 238 قانون مالیات مستقیم با ممیز مالیاتی در مورد میزان مالیات به توافق برسد. اگر اینطور نشد، پرونده او و شکایتش در هیأت حل اختلاف مالیاتی بررسی خواهد شد. این هیأت از سه نفر تشکیل میشود. یکی از آنها نماینده سازمان است که البته حضورش در جلسه اجباری نیست. نفر بعد را رئیس دادگستری مامور مینماید. اینکه کدام ارگان در جایگاه سوم قرار بگیرد را مودی انتخاب میکند.شما از میان صنعت و معدن، اصناف و … حق انتخاب دارید. شما باید در مرحله اعتراض 238 در ادامه لایحه خود و پیش از ارجاع پرونده به هیأت نماینده خود را برگزینید. در غیر اینصورت سامانه بصورت خودکار نماینده ای از جانب شما انتخاب میکند. جلسه رسیدگی باید حداقل 10 روز قبل از برگزاری به مودی ابلاغ گردد. هیأت حل اختلاف مالیاتی بدوی نهایتا تا 3 روز حکم خود را به شما ابلاغ میکند. در ادامه شما پس از دریافت ابلاغ رای هیأت بدوی، 20 روز فرصت دارید تا به آن نیز اعتراض نمایید. مالیاتی که هیأت تجدید نظر مشخص میکند قطعی و لازم الاجراست و مودی باید آنرا بپردازد. با اینحال اگر هنوز به این مبلغ معترض است میتواند اعتراض خود را از روشهای دیگری قانون پیش بینی کرده است، دنبال نموده و در صورت موفقیت مبلغی که اضافه پرداخت نموده را پس بگیرد.